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新冠病毒有“多長”？德爾塔變異株如何查“家譜”？

2021-08-07 央視新聞客戶端責(zé)任編輯：李雅蘭

原標(biāo)題：新冠病毒有“多長”？上海疾控詳解：德爾塔變異株如何查“家譜”？

6日，記者從上海市疾控中心獲悉，此前其通報(bào)：上海市8月2日新增的1例新冠肺炎確診病例感染的新冠病毒基因測序結(jié)果顯示，屬于德爾塔（delta）變異株，與境外德爾塔變異株同源性較高。基因同源性較高是什么意思？基因測序是如何發(fā)現(xiàn)病毒基因與境外變異株高度相似的？來看上海市疾控中心的解答。

新冠病毒就像一條手鏈，可以由不同的珠子串起來，手鏈上的每顆珠子都是具有特殊功能的基因。當(dāng)把珠子放大，就會(huì)發(fā)現(xiàn)每顆珠子都是由四種堿基緊密排列組成的。所以，基因測序就是先發(fā)現(xiàn)珠子，再放大看其中的堿基是怎么排列的；當(dāng)把堿基排列情況看清楚時(shí)，就可以完全測定出來新冠病毒的核酸序列。

新冠病毒這條“手鏈”的長度為29903（約3萬）個(gè)堿基。在以前技術(shù)不是那么發(fā)達(dá)的時(shí)候，技術(shù)人員測定整個(gè)基因組可能要耗費(fèi)數(shù)周甚至數(shù)月的時(shí)間。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，憑借全基因組測序技術(shù)，可以一次性完成之前數(shù)月的工作。當(dāng)然，這項(xiàng)技術(shù)操作起來比較復(fù)雜，不僅僅需要在實(shí)驗(yàn)室里進(jìn)行，還需要高性能計(jì)算機(jī)，至少分析數(shù)小時(shí)才能完成。

測定出新冠病毒的序列后，就可以分型了。

還是拿手鏈打比方，通過對比不同“手鏈”的差異，我們可以將相似的“鏈子”歸到同一個(gè)“系列”，這個(gè)過程叫分型。

各種分型方法的原理是類似的，都是利用病毒傳播過程中核酸序列上特定位置的變化來進(jìn)行分型，這對防控工作十分重要，是明確病毒來源并調(diào)整防控策略的重要依據(jù)之一。

為什么能通過基因測序鎖定病毒來源

上海市疾控中心對上海市8月2日病例的呼吸道標(biāo)本開展了新冠病毒全基因組序列測定，結(jié)果顯示，雖然該病毒屬于德爾塔型，但它的變異情況和一株北美株高度相似，而與近期我國其他地區(qū)的病例感染的病毒變異不一樣。結(jié)合病例的工作性質(zhì)，因此推測此次本土病例感染來源很可能是國外而不是國內(nèi)其他地區(qū)。

病毒發(fā)生變異后，這些變異會(huì)遺傳給病毒的下一代并且不大可能返祖，也就是說處在同一傳播鏈條上的病例帶有的病毒肯定會(huì)包含之前傳播者帶有的病毒的全部變異。因此，通過比較病毒變異是否一致，我們就可以判斷兩個(gè)病例之間是不是在同一傳播鏈上，一例一例比較后能精準(zhǔn)地推斷病毒的來源。

基因測序還有更多高大上的作用

科學(xué)家通過對病毒進(jìn)行全基因組測序，可以了解新冠病毒不同傳播階段的變異情況，由此推測病毒對人的感染力的變化情況。

還可以了解現(xiàn)在的核酸檢測診斷試劑是否有效，因?yàn)楹怂釞z測僅僅是檢測病毒核酸序列的一部分，如果被檢測的這部分序列發(fā)生改變，那么就需要對檢測試劑進(jìn)行改進(jìn)了。

另外，疫苗研發(fā)者可利用基因組測序技術(shù)觀察病毒變化情況，研究現(xiàn)有疫苗或正在研發(fā)的疫苗是否有效，從而對疫苗的研發(fā)策略進(jìn)行修改，讓疫苗更有針對性。（記者王殿甲）

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