寧波口岸運(yùn)用DNA條形碼技術(shù)鑒定鼠類病媒

日前，寧波大榭出入境檢驗(yàn)檢疫局工作人員在一批沙特阿拉伯的入境空箱進(jìn)行檢疫查驗(yàn)時(shí)發(fā)現(xiàn)一個(gè)干枯的鼠類樣本，經(jīng)大榭鼠傳疾病檢測實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用DNA條形碼技術(shù)鑒定為板齒鼠，這是浙江省口岸首次截獲該鼠種。

據(jù)介紹，板齒鼠可傳播恙蟲病、鉤端螺旋體病、Q熱、鼠形斑疹傷寒、鼠疫等疾病。根據(jù)世界哺乳動(dòng)物名典(Wilson&Reeder，第三版)，該鼠種主要分布于巴基斯坦、印度、斯里蘭卡、尼泊爾、孟加拉國、緬甸和沙特阿拉伯。

據(jù)了解，寧波出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心大榭分中心鼠傳疾病檢測實(shí)驗(yàn)室于2013年9月獲批設(shè)立，承擔(dān)寧波各口岸鼠類樣本的鑒定和病原體檢測工作。截至2013年12月，寧波口岸發(fā)現(xiàn)各類醫(yī)學(xué)媒介生物21種26582只。

實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人謝東華告訴記者，對于這種外來輸入且體型不全、國內(nèi)未分布或不常見的鼠種，很難僅憑形態(tài)學(xué)進(jìn)行種類鑒定。該實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用DNA條形碼技術(shù)，通過對鼠皮毛DNA基因序列進(jìn)行分析，與Genbank中已公布的鼠類數(shù)據(jù)進(jìn)行比對，并將僅存老鼠的頭骨形態(tài)與鼠種鑒定圖譜進(jìn)行了比較，最后判定為板齒鼠。

2013年8月份，中國口岸首次截獲孟加拉板齒鼠。

“靠傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法進(jìn)行鼠種鑒定受人的主觀因素影響較大，較難形成一個(gè)統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。”謝東華告訴記者，“運(yùn)用DNA條形碼技術(shù)在提高種類鑒定準(zhǔn)確性的同時(shí)，也將檢疫周期縮短了3至5天。”謝東華告訴記者。

實(shí)驗(yàn)室高級(jí)工程師胡群告訴記者，DNA條形碼技術(shù)的廣泛應(yīng)用目前還很大程度上受數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)缺乏的限制，通常同一個(gè)鼠種并不是每個(gè)DNA條形碼序列都有已公布的數(shù)據(jù)。如果只采用單個(gè)DNA條形碼序列可能因?yàn)橥吹氖蠓N在基因庫中尚無公布序列而被劃分到其他鼠種范圍內(nèi)，在應(yīng)用過程中可能造成錯(cuò)判。

為提高鼠種鑒定準(zhǔn)確性，實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)將常規(guī)利用單個(gè)DNA條形碼標(biāo)簽的鑒別判斷方法進(jìn)行改進(jìn)，采用使用4個(gè)DNA標(biāo)簽進(jìn)行聯(lián)合應(yīng)用，同時(shí)針對性的對鼠類各個(gè)DNA標(biāo)簽序列進(jìn)行優(yōu)化，成功建立起滿足目前實(shí)際檢測工作的鼠種鑒定方法。并成功應(yīng)用于口岸醫(yī)學(xué)媒介生物監(jiān)測工作中捕獲個(gè)體不完整或形態(tài)特性不明顯的鼠種鑒定。

據(jù)悉，大榭鼠傳疾病檢測實(shí)驗(yàn)室還將該技術(shù)用于細(xì)菌溯源。同時(shí)，實(shí)驗(yàn)室逐步將DNA條形碼技術(shù)應(yīng)用于蚊、蠅、蜚蠊等病媒生物的種類鑒定。